下面是范文网小编收集的加工贸易流程3篇(加工贸易操作规程)，以供借鉴。
加工贸易流程1
一、首次开展加工贸易业务的企业备案
首次开展加工贸易业务的企业，应向海关办理企业备案手续。办理企业备案手续应提交的单证及流程如下：
（一）应提交单证
1.加工企业（1）工商营业执照复印件；（2）税务登记证复印件；（3）加工企业的《对外加工企业登记表》复印件；（4）海关签发的《对外加工生产企业海关登记通知书》复印件；（5）外经贸主管部门签发的《加工贸易加工企业生产能力证明》正本；（6）《企业印章印鉴备案表》。
2.经营单位
（1）国家主管部门准予经营进出口业务的批准文件复印件；（2）工商营业执照复印件；（3）海关签发的《报关注册证明书》复印件；（4）《企业印章印鉴备案表》。
3.外商投资企业
（1）国家主管部门核发的《外商投资企业批准证书》复印件；（2）工商行政主管部门签发的营业执照复印件；
（3）海关签发的《自理报关企业报关注册证明书》复印件；（4）《企业印章印鉴备案表》；（5）企业合同、章程复印件各一份；（6）外商投资企业的《外商投资企业登记表》复印件；（7）税务登记证复印件；（8）外经贸主管部门签发的《加工贸易加工企业生产能力证明》正本。
（二）作业流程
企业提交备案资料--海关验核--建立企业档案。
企业备案后，在符合海关监管要求情况下，可向加工生产企业所在地主管海关申请办理加工贸易合同登记备案手续。如企业备案情况发生变更，企业应向原外经贸审批部门办理变更手续，并在7天内将变更内容书面报告主管海关。
二、加工贸易合同登记备案
企业办理合同备案海关手续应提交的单证及流程如下：
（一）应提交单证1.经营企业对外签定的进出口合同一式两份2.外经贸部门签发的《加工贸易业务批准证》一式两份；3.本《加工贸易加工企业生产能力证明》复印件一份；
4.《合同执行情况表》；5.《登记手册》；6.《合同预录入呈报表》一份；7.新产品生产工艺流程图及成品所需料件单耗情况；8.外贸、工贸公司进料加工还需提供主管出口退税的税务机关签章；9.按规定需提交的其他单证。
（二）作业流程
合同预录入—向海关申报--海关审核—海关签发《银行保证金台帐开设联系单》—企业到指定银行办理台帐登记手续—海关登记《银行保证金台帐登记通知单》——核发《登记手册》。
三、异地加工
企业办理异地加工贸易海关手续应提交的单证及流程如下：
（一）应提交单证
1.向经营单位主管海关办理异地加工贸易申请，应提交如下单证：（1）经营单位所在地外经贸主管部门核发的《加工贸易业务批准证》一式两份；（2）加工企业注册地县级以上外经贸主管部门出具的本《加工贸易生产能力证明》复印件一式两份；（3）《中华人民共和国海关异地加工贸易申请表》（以下简称《异地加工贸易申请表》）；（4）经营企业对外签定的进出口合同一式两份。（5）双方企业签订的符合《中华人民共和国合同法》规定的委托加工合同一份；（6）按规定需提交的其他单证。
2.向加工企业主管海关办理异地加工合同备案手续，应提交如下单证：（1）经营单位主管海关加封的内有《异地加工贸易申请表》、《加工贸易业务批准证》、《加工贸易生产能力证明》、《进出口合同》的关封；（2）双方签订的符合《中华人民共和国合同法》规定的“委托加工合同”一式两份；（3）合同预录入呈批表一份；（4）按规定需提交的其他单证。
（二）作业流程
向经营单位主管海关申办异地加工—经营单位主管海关审核并制作关封交经营单位--向加工企业主管海关申请异地加工合同备案—海关审核并按规定备案合同、核发《登记手册》。
四、合同变更
企业办理合同变更海关手续应提交的单证及流程如下：
（一）应提交单证：1.变更合同一式两份；2.外经贸部门签发的《加工贸易业务批准证》一式两份；3.海关核发的《登记手册》；4.《变更预录入呈报表》；5.按规定需提交的其他单证。
（二）作业流程
企业报原加工贸易审批机关批准——企业向海关申请--海关审核—海关签发《银行保证金台帐变更联系单》—企业到指定银行办理台帐变更手续——登记《银行保证金台帐变更通知单》—核发已变更《登记手册》。
五、加工贸易分册
企业申办加工贸易分册及分册变更手续应提交的单证及流程如下：
（一）应提交单证1.《加工贸易分册申请表》；
2.海关核发的加工贸易《登记手册》（总册）；3.《登记手册》（分册）；4.按规定需提交的其他单证。
（二）分册变更
1.分册进口及出口商品的序号、品名、规格型号、计量单位不得变更；2.总册发生变更，涉及下列情况的，分册内容应做相应变更：（1）删除总册某一异地口岸；（2）删除总册进口或出口商品项；（3）减少总册某一进口料件或出口成品数量。
（三）作业流程
企业向海关申请--海关审核—核发分册。
六、发外加工
企业办理发外加工手续应提交的单证及有关规定如下：
（一）企业申请外发加工，应同时符合下列四个条件：1.对在生产加工过程中的某个加工工序，企业无生产条件，确需委托其他企业加工，且产权不转移的；2.委托企业须事先向主管海关提出外发加工的书面申请，说明申请理由、受委托的加工企业情况、损耗情况及加工后返还日期等；3.委托企业与加工企业须签订符合《中华人民共和国合同法》规定的“委托加工合同”；4.外发加工料件必须从委托企业发出，加工完毕后，产品、余料、边角料等必须全部返回委托企业。
（二）应提交单证
1.《中华人民共和国海关保税货物委托加工申请表》（以下简称《委托加工申请表》）一式三份；2.委托加工合同二份；3.委托企业及承接加工企业《营业执照》、法定代表人身份证明复印件；4.《登记手册》；5.按规定需提交的其他单证。
（三）外发加工成品必须在海关规定的期限内运回委托企业。合同核销时，委托企业须向海关提交《委托加工申请表》和有关送货单。
七、深加工结转
（一）向转出地海关备案开展深加工结转，应提交单证：1出口方的《登记手册》（复印件），复印内容应包括手册封面、加工合同备案情况表；2《申请表》（一式四联）；
（二）向转入地海关申请开展深加工结转，应提交单证：1《申请表》（第二、三、四联）；2结转双方企业的《登记手册》（复印件），复印内容应包括手册封面、加工合同备案情况表；
（三）作业流程企业向转出地海关备案—企业向转入地海关申报—经转入地海关批准后，转入、转出企业在结转计划有效期内送货完毕—转入、转出企业各自向其主管海关如实办理报关手续。
八、合同余料结转
应提交单证：
（一）转入、转出企业的《登记手册》；
（二）进口和出口货物报关单（手写单）；
（三）申请企业的书面报告；
（四）余料结转申请表。
九、保税货物内销
（一）应提交单证
1.《登记手册》；
2.进口货物报关单（手写单）；
3.申请企业的书面报告；
4.外经贸主管部门的批件；
5.按规定需交验的各种许可证件；
（二）作业流程
企业向海关加工贸易监管部门申请--海关审核并制作关封交企业—企业到通关现场办理征税手续。
十、加工贸易料件退运或退换的处理
（一）受理范围
1.加工贸易进口料件在进境结关后因发错货、料件质量及规格型号不符，需退运或退换的；2.合同中止或变更，有关原材料需退运出境的；3.合同执行完毕，办理核销手续时，剩余料件需退运出境的；4.退运的类别：来料料件复出0265、来料料件退换0300、来料边角料复出0865、进料料件复出0664、进料料件退换0700、进料边角料复出0864。对直接退运货物，按直接退运货物的管理办法办理。
（二）应提交单证
1.书面申请报告（说明退换或退运的原因、复进口的时间，由合同双方签章）；2.《登记手册》；3.原进口货物报关单复印件以及手写出口报关单（原材料退运才提供）；4.《加工贸易料件退运申请表》一式两份；5.按规定需提交的其他单证（如外商要求退运的有关文件，质量检验证明等）。
（三）作业流程
企业向海关加工贸易监管部门申请--海关审核并制作关封交企业—企业到通关现场办理手续。
十一、因自然灾害造成保税货物受损的处理
（一）因自然灾害造成保税货物受损，企业应在灾后7日内向主管海关书面报告；
（二）企业办理因自然灾害而受损保税货物征、免税手续，应提交单证：1.《登记手册》；2.进口和出口报关单；3.经外经贸主管部门加注认可意见的申请企业的书面报告；4.公安消防部门出具的火灾鉴定证明（限火灾受损的情况）；5.商品检验检疫部门出具的灾后残次品检验证明或保险公司出具的保险赔款通知书；6.海关认可的其它有效证明文件。
十二、手册续本
（一）加工贸易手册进出口栏目填满后仍有进出口业务的，企业可向主管海关申请核发手册续本。
（二）应提交单证
1.书面申请报告；
2.原《登记手册》。
（三）作业流程
企业申请--海关审核—核发续本。
十三、合同核销结案
（一）企业应在《登记手册》到期或最后一批加工成品出口后的一个月内向海关办理合同核销结案手续。
（二）应提交单证
1.《登记手册》（含续册及分册）；2.《对外加工装配合同核销申请表》或《进料加工合同核销申请表》（以下简称《核销申请表》一式两份；3.进出口货物报关单；4.《合同核销预录入呈报表》；5.海关认为必要的其他单证（1）内销补税报关单及税单；（2）申请放弃进口保税货物提交书面申请报告；（3）涉及料件补税提供《内销批准证》及必要的许可证件；（4）边角料、残次品等内销补税申请报告；（5）其它单证；
（三）作业流程企业提出核销申请—海关审核—海关开具《银行保证金台帐核销联系单》—企业到中行核销台帐—海关登记《银行保证金台帐核销登记单》—海关签发《核销申请（结案）表》。
十四、遗失《登记手册》
企业遗失《登记手册》应及时报主管海关，同时提交如下单证：
（一）申请企业的书面报告（须有企业法人代表签章）；
（二）公安机关出具的证明；
（三）刊登遗失手册声明的县级以上机关报；
（四）进出口货物清表一式两联（表内应注明“内容属实，如有不实，由海关按有关规定处罚”）；
（五）进出口货物报关单（如企业无法提交进出口货物报关单，须提交原进出口口岸海关的查单情况证明）；
（六）原缴纳海关监管手续费票据；如该《登记手册》仍有进口料件未加工或加工成品未出口的，经海关审核同意，可办理余料结转、退运或成品出口等手续。
十五、放弃《登记手册》
合同在有效期内无货物进出口，企业放弃执行《登记手册》的，应提交以下单证：
（一）经外经贸主管部门加注认可意见的申请企业的书面报告；
（二）企业声明没有使用该《登记手册》进出口货物的书面保证（须有企业法定代表人签章）；
（三）《登记手册》；
十六、下厂核查
（一）海关下厂核查时，企业必须准备以下单证：
1.财会帐：自营出口销售帐（来料加工无此帐）；固定资产帐；应收、应付帐；委托加工帐；库存出口产品帐；内销帐；银行存款帐；成本帐；现金日记帐等各类帐册以及有关记帐凭证；审计报告等。
2.仓库帐：原材料进出仓帐；成品进出仓帐；进出仓单；送货单；仓库盘点记录表；成品装箱单等。
3.车间领料单、备料单；生产记录单；料件组合、配方表等生产资料。
4.所有在执行的《登记手册》原件或复印件。
5.海关需要的其他单证。
（二）海关下厂核查时，企业负责人、财务人员、报关人员、仓管人员等有关人员必须到场，配合海关开展工作。
（三）企业应签收下厂关员送达的《外勤工作通知书》，并按要求据实反馈有关情况。
加工贸易流程2
手册办理流程如下：
一、先申请办理加工贸易业务批准证。（办这个证就需要用到外经委的电子钥匙进行网上申报）。具体流程及所需要资料如下：
1）进口料件合同（复本）
2）出口成品合同（复本）
3）加工贸易业务批准证申请表（网上系统里有表格可以填好，等主管外经贸部门审核通过后打印现来即可）这里需要注意的是上面的所有信息都是跟据进出口合同上的金额，数字及品名来填的，不可以与进出口合同不一致。
4）进口料件备案登记表（网上系统里有表格可以填好，等主管外经贸部门审核通过后打印现来即可）这里所填报的进口料件要与进口合同一致，且要与以后要办理的手册上的进品料件一致，尤其是海关编码不可以选错，品名描述一定要按海关规定来填写，因为这里审批好之后还要去海关审批，如果通不过去改单比较麻烦和费时。且进口的料件一定要与这个数字一致，多进少进都不行，多进的要补税，少进还比较好处理一点。
5）出口成品备案登记表（也是在网上填好，发到当地外经贸主管部门审核的）出口成品要与合同一致，且以后出口要严格按照此表格上的数量来出货，多出少出都不行。否则无法核销的进口料件或补进口关税。
6）成品对应料件单耗表。这里要填的是成品单耗（这里的单耗是含正常损耗的，也就是你填上去的数字乘以出口成品数量要刚好等于进品料件数量，不能有余料的）。这个是进料和来料加工中最难做的一点，单耗一旦备案是不能更改的，如果错了，让海关查出来，余料一般要补税或交到海关仓库的。
所有资料填好后发到当地主管外经贸部门审批，这里需要注意的是以上6份表格要准备1式4套（所有单证上要敲公章），一套一套按顺序订好，拿过去审批。拿去之后，外经贸主部门留一套，发给你三套，其中有一套是需要拿到海关备案的（上面盖有骑缝章），一套自已留底（以后要改单或是内销或是什么样的时候要用），还一套要到国税局备案。
二、外经贸主管部门备案好之后，拿外经贸主管部门审批的，《加工贸易业务批准证》到国税备案。记得把三套全拿去，国税会留下一套备案，另外两套敲章还给你。
三、这些都办好之后就可以用CJ2000系统进行网上审报手册了。办理手册需要提交的资料如下：
1）外经贸主管部门审批签发的《加工贸易业务批准证》（记得这一套是外经贸主管部门盖骑缝章的那份，里面有进口料件合同和出口成品合同。）
2）委托加工协议（如是有自营进出口权的工厂，就不用了）。
3）企业生产能力证明（如属于委托加工行为，两家单位都要的）.第一次办理要正本，以后可以复印件盖公章。
4）银行开户许可证（每次办理手册都要，需要多复印一些留着，要用时盖上公章即可）
5）加工贸易合同备案申请表 表一:加工贸易合同概况表，需要用到CJ2000系统在网上填写，填好后发到海关审核。这份与办理加工贸易业务批准证要填的内容差不多，在做的时候一定要做到彼此一致。嘉兴海关是到这个网起址办理的：
要求办理加工贸易业务批准证一样
7）表三：出口成品表 与办理加工贸易业务批准证时一样的内容要填
8）表四：成品对应料件单损耗情况表与办理加工贸易业务批准证时一样的内容要填,而且要做到彼此一致。5）到8）点所有表格都是到CJ2000里面网上填报，发送到海关的，在海关有确认之前要自已打印出来敲公章，因为海关一旦确认之后，手册核发掉之后，这几份表格你就无权调出来了，到海关调单出来要收费的。
9）中华人民共和国海关加工贸易单耗审报单，这份表格是到海关的网站上下载，并自已填好打印的，敲上公章。具体可以参考海关总署公告2007年第23号，这份公告各地海关网站上都有，用GOOGLE搜一下就出来，下面有附件的。
10）空白手册一本。到海关买的，RMB5块一本，记得拿到之后在上面盖上公章。把上面提到的所有东东都放在里面，交到海关。
11）排料图，这个很重要，是海关审核服装企业单耗是否合理的依据。如果不是做服装的企业，需要提供的是其它资料，以证明自已的出口成品是需要用多少原料的。
上面10份单证是每次办理手册需要提交的单据，如果是第一次到海关办理手册，还需要提交以下资料：
1)营业执照（复印件盖公章）（如委托加工，则两家单位都要）
2)税务登记证（复印件盖公章）（如委托加工，则两家单位都要）
3）组织机构代码证（复印件盖公章）（如委托加工，则两家单位都要）
4）房屋产权证（复印件盖公章）（如委托加工，则两家单位都要）
5）外商投资企业业务批准证（如是三资或外贸投资企业需提供）
6）生产单位开户许可证（第一次办理，属于委托加工的要提供，如果是自已进料，自已加工，就没有这份文件了）
上面6份资料需要扫描通过CJ2000系统上传到海关和填好的表格一起发送到海关。
如果没有问题，海关审好之后就可以交钱拿手册了（所交金额大概在70块，是海关的预录入费），如果第一次办理要交风险担保金（与进口关税+增值税等值金额），交完之后才可以拿手册。第二次办理就不用交了。但是如果你们进口或出口的产品属于限制类的，则第二次要交保证金，而且如果你的加工单位或经营单位任何一方是属于厂房租赁的，第二次办理还是要交风险担保金的。
加工贸易流程3
加工贸易流程
一、了解加工贸易述语
加工贸易，是指经营企业进口全部或者部分原辅材料、零部件、元器件、包装物料（以下简称料件），经加工或者装配后，将制成品复出口的经营活动，包括来料加工和进料加工。
来料加工，是指进口料件由境外企业提供，经营企业不需要付汇进口，按照境外企业的要求进行加工或者装配，只收取加工费，制成品由境外企业销售的经营活动。
进料加工，是指进口料件由经营企业付汇进口，制成品由经营企业外销出口的经营活动。
加工贸易货物，是指加工贸易项下的进口料件、加工成品以及加工过程中产生的边角料、残次品、副产品等。加工贸易货物不得抵押、质押、留置。
加工贸易企业，包括经海关注册登记的经营企业和加工企业。
经营企业，是指负责对外签订加工贸易进出口合同的各类进出口企业和外商投资企业，以及经批准获得来料加工经营许可的对外加工装配服务公司。加工企业，是指接受经营企业委托，负责对进口料件进行加工或者装配，且具有法人资格的生产企业，以及由经营企业设立的虽不具有法人资格，但实行相对独立核算并已经办理工商营业证（执照）的工厂。
单位耗料量，是指加工贸易企业在正常生产条件下加工生产单位出口成品所耗用的进口料件的数量，简称单耗。
深加工结转，是指加工贸易企业将保税进口料件加工的产品转至另一加工贸易企业进一步加工后复出口的经营活动。
承揽企业，是指与经营企业签订加工合同，承接经营企业委托的外发加工业务的生产企业。承揽企业须经海关注册登记，具有相应的加工生产能力。外发加工，是指加工贸易企业因受自身生产工序限制，经海关批准并办理有关手续，委托承揽企业对加工贸易货物的某道工序进行加工，在规定期限内将加工后的产品运回本企业并最终复出口的行为。
核销，是指加工贸易经营企业加工复出口或者办理内销等海关手续后，凭规定单证向海关申请解除监管，海关经审查、核查属实且符合有关法律、行政法规、规章的规定，予以办理解除监管手续的行为。
二、加工贸易生产能力证明（有效期一年，每年需审批）从事加工贸易业务的企业（包括经营企业和生产企业），必须网络填报《加工贸易企业经营状况及生产能力证明》，否则企业将无法实现加工贸易网上审批。企业填报网址为： 按钮后系统会自动取得企业代码（使用该项登录的企业没有用户名和密码），点击后就直接登录了。
2、登录后，点击“申报历史”界面如下：
3、点击“表格填写”，出现如下界面，再点击“表二”，因为我们既是生产企业又是经营企业。
点击“表二”后，出现如下表格，我们按实填写就可以了，填好后保存，申报到“相应的外经贸审批点”。
4、审批需携带的资料（审批为三个工作日）网上确认同意批准以后，携带打印出来的资料两份（原件）、营业执照、组织机构代码、税务登记证、上财务报表（加盖单位公章）、验资报告到相应外经贸易审批点递交资料，拿加核签后的《加工贸易企业经营状况及生产能力证明》。
三、加工贸易业务（合同）审批：
加工贸易申领系统，使用有效期一年，需要付费，双击桌面上的快捷方式，进入系统。网上申报前要做好充足的准备，比如：准备好进出口合同、查好进出口料件的HS编码、确认好单损耗等。（网上申报时间（30分钟），资料准备时间看情况而定。）
（一）新建合同申请
点击左边方框中的“合同申请”，建立新的加工贸易申请合同，也可以从已有的进出口合同生成进料、来料加工合同申请，点击导航栏中“加工贸易”的合同申请 按钮，或者选择主菜单“加工贸易-合同申请”命令，进入合同申请信息页面。
再点击加工贸易窗口的“新建”按钮，弹出新建合同窗口，选择合同类型，输入申请文号后，点击确定按钮，进入申请合同录入界面。
申请表
出口币种：选择出口币种。
进口币种：选择进口币种。
经营企业名称：系统初始化时从证书中读入的信息，此处不可修改。
加工企业名称：选择加工企业，与其相关的信息会自动调出。客供辅料合同号：输入客供辅料合同号。
进口合同号：如果处理的是进口料件加工贸易业务，则需输入进口合同号，否则无需输入。
出口合同号：如果处理的是非出口业务，则无需输入出口合同号，否则必须输入出口合同号。制成品返销截至日期：为必填信息，否则无法继续。
国产料件总值：在检查合同时，系统会自动计算国产料件的总值并将其填至此处，用户也可自行录入。深加工结转金额：全部输好后自动生成。
信息录入完毕后，点击进口料件标签，进入进口料件输入界面，（注意保存）。
进口料件
方式（选择）：即进口方式需选择进口还是转入。设备、辅料：进口料件的性质，根据需要选中即可。
商品代码：点击 弹出企业商品库，企业商品库是根据用户以前从标准商品库中选择过的商品而建立的，可以帮助企业快速找到所需商品，用户也可从标准商品库中选择商品。
规格、数量、单位：按实际输入
原币名称：选择原币币种。
单价（美元）：根据用户输入的原币金额自动计算而得，无需用户输入。进口国、原产地名称：选择输入进可。进口口岸：输入实际进口口岸。
进口料件输入完毕后，点击出口成品标签，进入到出口成品输入界面。
出口成品
可以参考进口料件操作方法。
进口料件单耗
输入完出口成品后，点击进口料件单耗，进入进口料件单耗输入界面。
点击进口料件序号框内的下拉菜单，选择前面输入的进口料件，然后输入该料件的单耗、损耗率等信息，以此类推，完成进口料件单耗的输入。
国产料件
请参考进口料件操作方法，如果没有就可以不填。
国产单耗
请参考进口料件单耗操作方法如果没有就可以不填。
加工企业
请参考进口料件操作方法，如果没有就可以不填。
国外厂商
请参考进口料件操作方法，如果没有就可以不填。
所有信息输入完毕后，点击存盘按钮保存数据，并退出窗口。
2、修改合同
选择需要修改的合同，点击 按钮即可打开该合同进行修改。修改完毕后存盘退出。
3、复制合同 选择需要复制的合同，点击 按钮，弹出选择复制内容对话框，选择需要复制的信息，输入新合同的申请文号，然后点击“确认”按钮即可复制出一份新的合同申请。
4、删除合同
选中需要删除的合同，点击 按钮即可删除该合同。选中多条合同时，可以同时删除这些合同。
5、检查并发送合同
合同申请编辑完成后，必须经过检查才能向上级主管部门申报。选择需要检查的合同，点击 按钮，弹出合同检查对话框，如果合同内容错误信息框中显示有错误信息，则检查将不能通过，合同不能发送。只有通过检查的合同才可以进行发送操作。选中需要发送的合同，点击 按钮，向指定的主管部门发送合同申请。也可选中多条合同一起发送。合同发送成功后，该合同的状态同时变为“已发”状态。
7、接收合同
外经贸收到企业上报的合同（新申请合同、核销合同、变更合同、内销合同等）并做出审批操作后，发回给相应的企业。用户可以通过点击导航栏中“加工贸易”里的接收合同 按钮接收合同。对于新申请合同，如果审批通过，则合同状态会变为“已批”，同时合同转入“已批合同”内，点击导航栏中“加工贸易”里的已批合同 按钮即可查看该合同；如果审批不通过，则合同状态将变为“已批不通过”，仍然在“合同申请”里，用户可以对它进行相应的修改，然后再检查、发送即可。
8、提交材料：
审批通过后，打印《加工贸易业务批准证申请表》、加工协议或进出口合同、进口料件申请备案清单、出口制成品及对应进口料件消耗备案清单（都要盖公章），到相应外经贸当面提交材料，让老师当面审批，拿回外经贸核发的《加工贸易业务批准证》。
（三）已批合同
点击导航栏中“加工贸易”的已批合同 按钮，进入到已批合同列表界面。
1、已批合同核销及发送
选择一个需要核销的已批合同，点击加贸工具栏上的 核销按钮，弹出合同核销窗口：在报关单号后面的文本框内输入报关单号，然后点击 按钮，在弹出的窗口里输入报关单数据：实际进口料件和实际出口商品数据。输入完毕后点击 保存按钮，退出该窗口。在核销申请窗口里，输入海关手册编码，点击 按钮，确认无误后点击 保存按钮即可保存核销信息。如果选择进口料件[1]标签页，然后点击 删除按钮，将可删除实际进口料件数据；选择出口成品[2]标签页，然后点击 删除按钮，将可删除实际出口商品数据。如果所有的数据全部核销完毕，可选中“数据已全部核销”选项，此时会弹出确认窗口：确认合同数据已全部核销完毕，此后不能再继续核销！点击“是”按钮，表示该合同已全部核销，否则该合同为部分核销。状态标志为部分核销的合同以后还可以继续核销，操作方法同上。数据全部核销的合同可以向审批机关发送，而部分核销的合同将不能发送。所以在核销合同发送前，请确认该合同是否已全部核销。选中需要发送的合同，然后点击 发送按钮，即可发送该合同。
（四）变更合同（延期也通过变更合同来实现）
已批合同经过变更操作后，将会出现在合同申请列表框里，作为新的申请合同出现。
点击导航栏中“加工贸易”里的变更合同 按钮，弹出变更合同对话框，选择申请类型和需要变更的合同，然后输入新的申请文号，点击“确认”按钮，即可打开新的申请合同。其内容和第一节的申请合同基本相似，不同之处在于多了一个“变更情况”的标签页，输入申请变更项目等内容，并对某些数据做出必要修改后，点击保存 按钮，该合同将转到合同申请里，状态为编辑状态。提交材料：
审批通过后，打印变更后的《加工贸易业务批准证申请表》、《加工贸易业务批准证变更申请表》、变更后的加工协议或进出口合同、进口料件申请备案清单、出口制成品及对应进口料件消耗备案清单（都要盖公章），到相应外经贸当面提交材料，让老师当面审批，拿回外经贸核发的《加工贸易业务批准证》。
（五）内销合同
点击导航栏中“加工贸易”里的内销合同 按钮，进入到内销合同管理界面。
1、新建内销合同
点击新建 按钮，弹出如下图所示的对话框。选择一个要做内销的合同，输入内销合同的申请文号，然后点击“确认”按钮，进入到编辑内销信息界面，如下：
内销基本信息
内销批准证号：审批机关填入的信息，已批内销合同上将会有具体证号
内销申请文号：上个界面所填写的申请文号，此处不可更改
加工贸易经营企业名称、代码：此处不可更改这些数据
加工贸易业务批准证号：审批机关给申请合同的批准证号，此处不可更改 输入海关加工贸易登记手册号后，点击内销料件清单标签页，进入到内销料件清单界面。
内销料件清单
点击进口商品序号文本框里的 按钮，在弹出的产品选择对话框里选择内销处理的料件，然后输入内销数量及金额等数据，全部输入完毕后点击保存 按钮保存数据。功能按钮使用说明：在编辑内销信息窗口里，点击打印 按钮，弹出打印对话框。在这里可以打印内销申请单和内销清单。
2、修改、查看内销合同及合同发送
处于编辑状态的内销合同可以继续修改。选择某个处于编辑状态的内销申请，点击 按钮，即可打开编辑内销信息窗口。对于已经发送和通过审批的内销合同，将不能修改，而只能显示数据。选择需要显示的内销申请，点击 按钮，即可打开内销信息查看窗口。选中需要发送（处于编辑状态）的内销申请，点击 按钮即可发送该合同申请。可选中多条内销合同一起发送。
3、删除内销合同
处于编辑状态的合同可以删除，但已经发送或已经过审批的内销合同将不能被删除。选中需要删除（处于编辑状态）的内销申请，点击 按钮即可删除该合同申请。可选中多条内销合同一起删除。
4、提交材料：
审批通过后，打印《内销申请表》、情况说明、内销料件清单（都要盖公章），到相应外经贸当面提交材料，让老师当面审批，拿回外经贸核发的《加工贸易业务批准证》。
四、向海关申领加工贸易手册
手册有效期为一年，在这期间如果我们出不完，或中途要变更，我们可以申请手册延期及变更。
（一）新手册申领需要资料如下（加盖公章）：
1、《加工贸易业务批准证申请表》1份
2、《加工贸易业务批准证》1份
3、《加工贸易企业经营状况及生产能力证明》1份
4、加工协议或进出口合同2份
5、报关委托书1份
6、加工贸易合同备案料件、成品归类申报表1份
7、中货人民共和国海关加工贸易单耗申报单（一个成品一份）注意：1、2、3是外经贸审批后，送至海关的。
准备好如上资料到相应海关输单，并通过相应报关行将资料上交到相应海关加工贸易科，一般一个3－5个工作日，便可以审批好，然后核发新手册。
（二）加工贸易手册变更及延期审批需要资料如下（加盖公章）
1、《加工贸易业务批准证变更申请表》
2、《加工贸易业务批准证》（变更证明）
3、变更后的加工协议或进出口合同
4、情况说明
5、报关委托书
准备好如上资料到相应海关输单，并通过相应报关行将资料上交到相应海关加工贸易科，一般一个3－5个工作日，便可以审批好。
注意：手册延期一般不得超过两次，每次延长期限一般不超过6个月。
五、加工贸易手册核销
手册有效期（一年）到之前，最少提前一个星期去海关进行核销。
（一）手册核销需要资料如下：
1、经营企业填制的《加工贸易核销申请表》，中须详细填写实际进口料件和出口成品的名称、数量、各种进口料件用于生产各项出口成品的实际单耗，进口总值以及余料、边角料、废料等情况
2、电子口岸法人卡
3、加工贸易专用进、出口报关单（正本）；
4、如果没有出完（未出完进口料件人民币小于元或小于3%不用向外经贸审批）或有边角料，还要情况说明，报核后还人补税。准备好如上资料到相应海关输单，并通过相应报关行将资料上交到相应海关加工贸易科。
六、加工贸易手册内销
申请办理加工贸易货物内销手续时，需要提交如下资料：
1、外经贸签发的《加工贸易进口料件内销批准证》；
2、经营企业申请内销加工贸易货物的书面材料；
3、情况说明
4、电子口岸法人卡。
准备好如上资料到相应海关输单，并通过相应报关行将资料上交到相应海关加工贸易科。
七、海关对加式贸易企业定期核查及自查
海关通过核实数据、审查单证、核对实物及相关帐册等方法检查核实加工贸易企业申报的加工生产能力以及进口、运输、存储、加工、装配、转让、转移、销售或者出口加工贸易货物等情况，是否与实际相符、是否符合有关法律、行政法规、规章规定，并要求企业自查，按要求提供自查报告。
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